Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DBX1A6NMT0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DBX1A6NMT0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DBX1A6NMT0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DBX1A6NMT0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DBX1A6NMT0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DBX1A6NMT0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DBX1A6NMT0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DBX1A6NMT0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DBX1A6NMT0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DBX1A6NMT0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DBX1A6NMT0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DBX1A6NMT0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DBX1A6NMT0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DBX1A6NMT0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DBX1A6NMT0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DBX1A6NMT0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DBX1A6NMT0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DBX1A6NMT0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DBX1A6NMT0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms