Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM221AA4D161 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM221AA4D161 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms