Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD3A2A2Y4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms