Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 FGG-204ENST00000405164 1539 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 WASF5P-205ENST00000428639 1455 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OR10AD1-201ENST00000310248 1305 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 WFDC8-201ENST00000289953 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 KLRG1-202ENST00000356986 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 HNRNPCP2-201ENST00000399515 881 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RNU2-5P-201ENST00000410533 180 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 IFNA12P-201ENST00000413147 571 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC009299.1-201ENST00000429684 717 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL604028.1-201ENST00000430643 598 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC000362.1-201ENST00000433725 425 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LINC02530-201ENST00000457945 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 HIGD1AP9-201ENST00000550710 279 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OR4F28P-201ENST00000559128 938 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LINC00469-203ENST00000579749 583 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RN7SL835P-201ENST00000579920 262 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 NDUFA3P1-201ENST00000588007 252 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OR4F8P-201ENST00000589943 937 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC015802.4-202ENST00000591967 474 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC108451.2-201ENST00000603875 538 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CT45A8-202ENST00000611660 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CT45A10-201ENST00000611668 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CT45A2-202ENST00000612907 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 COPS3-203ENST00000439936 1394 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms