Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 SKA2-207ENST00000583380 583 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 COLGALT2-203ENST00000367521 4723 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 ERG-210ENST00000442448 5034 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 NAV2-208ENST00000527559 11171 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 ARID1A-204ENST00000430799 6521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 MRO-211ENST00000610511 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AC104447.1-201ENST00000624214 2124 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 DOCK8-201ENST00000382329 6124 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 CSNK1A1-201ENST00000261798 6067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 BTBD3-214ENST00000618296 4582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 SPTAN1-201ENST00000358161 7794 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 TNC-203ENST00000423613 6281 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 UNC5C-201ENST00000453304 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 MTERF4-222ENST00000614476 4524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 TSC22D2-201ENST00000361875 11154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP34Q70CQ2 NOTCH2NL-203ENST00000578207 5042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 SLC24A1-202ENST00000339868 5678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 MYH2-202ENST00000397183 6078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 FXR1-202ENST00000357559 8711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 MTF1-201ENST00000373036 7972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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