Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CD34-201ENST00000310833 8246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ARHGEF15-201ENST00000361926 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AL590822.2-201ENST00000606533 4196 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LRRC55-201ENST00000497933 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RELA-205ENST00000525693 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MCMDC2-202ENST00000396592 2373 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LARP7-201ENST00000324052 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 CACNB2-202ENST00000324631 3446 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 PSG3-201ENST00000327495 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 SEMA6D-204ENST00000358066 5913 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 CDHR2-206ENST00000510636 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 PCDHGA2-202ENST00000528330 4543 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AL157714.2-203ENST00000438275 2400 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 PIK3C2B-204ENST00000424712 7522 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 EIF2D-201ENST00000271764 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 CCDC13-AS1-201ENST00000418161 2049 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 FLNB-203ENST00000419752 2002 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 CX3CL1-202ENST00000563383 3313 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 CLK1-201ENST00000321356 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ZNF550-201ENST00000325134 4305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 OTOG-203ENST00000399397 9948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 DCTN2-201ENST00000434715 1677 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 CDRT1-204ENST00000395906 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LINC01018-201ENST00000505626 3036 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 TNC-203ENST00000423613 6281 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LRP1-202ENST00000338962 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 PPRC1-202ENST00000370012 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 PSG4-202ENST00000405312 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 GNE-203ENST00000447283 2174 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 OR4D9-203ENST00000641962 6123 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RPL29P28-201ENST00000421928 472 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ACTG1P24-201ENST00000423783 877 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AL353150.1-202ENST00000429700 585 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 DISC1-IT1-201ENST00000456782 762 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AL391825.1-202ENST00000458136 741 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 IGKV1-37-201ENST00000465170 398 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC044787.1-201ENST00000497325 792 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MBL1P-202ENST00000497731 758 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 OCIAD1-210ENST00000506801 571 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 IGKV1D-37-201ENST00000509129 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RPL23AP96-201ENST00000514593 591 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC114550.1-201ENST00000518846 573 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LINC02454-202ENST00000541391 612 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC073254.1-210ENST00000597495 635 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 HLA-B-257ENST00000640094 147 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 OR55B1P-202ENST00000641245 1276 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 BX005040.3-201ENST00000611332 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 N6AMT1-202ENST00000351429 4781 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 NUPR1-201ENST00000324873 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 TGFA-201ENST00000295400 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ALDH1L1-AS2-202ENST00000500525 2236 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 CNTN2-232ENST00000640428 4146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 CSPG4P10-202ENST00000612093 3411 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 EBF3-202ENST00000368648 4375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 KCNJ15-206ENST00000398932 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 SLC12A3-202ENST00000438926 5567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 UBA1-203ENST00000377351 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MS4A14-209ENST00000531787 2537 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 NMT1-213ENST00000592782 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MARK2P13-201ENST00000419108 1849 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AL117329.1-201ENST00000423737 1815 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 GOLGA4-201ENST00000356847 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 PRKACB-206ENST00000370689 4513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 FCHSD1-201ENST00000435817 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 SIN3A-201ENST00000360439 5050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ALKBH8-204ENST00000417449 2114 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ZNF232-208ENST00000575898 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LPIN2-201ENST00000261596 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LRRK2-202ENST00000343742 4740 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AL021877.1-201ENST00000457251 2194 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 NRAP-203ENST00000369358 5534 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 WHRN-204ENST00000374059 3278 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 FLT3-201ENST00000241453 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 POTEA-201ENST00000519951 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ZNF567-202ENST00000536254 2825 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 FCRL3-201ENST00000368184 4725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ELMOD3-205ENST00000409344 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 PACSIN1-201ENST00000244458 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 CDY1-201ENST00000306609 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 CDY1B-201ENST00000306882 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 UBE2G1-201ENST00000396981 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 SLC22A24-202ENST00000417740 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 KDM5D-202ENST00000382806 5134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 WDR31-201ENST00000341761 4862 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 COG2-202ENST00000366669 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 WDR31-202ENST00000374193 4878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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