Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms