Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 MYRFL-203ENST00000547771 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM68-201ENST00000334667 2401 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CDC42SE2-208ENST00000505065 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFB4-201ENST00000184266 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TGIF2LY-201ENST00000321217 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CFAP61-207ENST00000389656 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TRBV6-6-201ENST00000390371 388 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RN7SKP42-201ENST00000410913 300 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02539-201ENST00000411615 737 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01799-201ENST00000411701 386 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC092042.2-201ENST00000417304 331 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RBMY2GP-201ENST00000418671 1034 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC012560.1-202ENST00000421324 535 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 Z98752.2-201ENST00000432727 312 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RPS3AP29-201ENST00000437728 769 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00350-201ENST00000438640 422 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00331-201ENST00000446391 376 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AL161646.1-201ENST00000447860 1013 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC104389.2-201ENST00000450768 887 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms