Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ZSCAN25-204ENST00000394152 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 PTPDC1-201ENST00000288976 4398 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 SLC24A1-201ENST00000261892 5768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 C8orf46-201ENST00000305454 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 ITGA7-203ENST00000452168 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 LINC00676-201ENST00000416090 474 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 MRPL40P1-201ENST00000542687 604 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 5S_rRNA.20-201ENST00000612104 118 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 AKT3-202ENST00000336199 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 SH3YL1-229ENST00000626873 1973 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 LINC00208-201ENST00000304233 2150 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 SP1-201ENST00000327443 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 ADGRF4-202ENST00000327753 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 ADGRF4-203ENST00000371220 3075 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 TRPM3-202ENST00000357533 5145 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRHP20396 MTHFD1-202ENST00000545908 6814 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 RIMS2-207ENST00000504942 4228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 HNRNPK-201ENST00000351839 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 SLC10A5-201ENST00000518568 2568 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 SRGAP2B-204ENST00000612199 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 CPEB4-209ENST00000522336 1551 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 FCN1-202ENST00000616356 4369 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC007938.4-201ENST00000610046 4118 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 TRPV1-202ENST00000399756 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC090983.1-201ENST00000623426 3897 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC092167.1-201ENST00000435466 495 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 FANK1-AS1-201ENST00000445458 428 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 RN7SL153P-201ENST00000486501 292 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC006335.3-201ENST00000613408 292 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 AP001120.1-201ENST00000561598 3710 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 MOCOS-201ENST00000261326 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 MYH8-201ENST00000403437 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 C14orf159-217ENST00000520328 2687 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 FCAMR-201ENST00000324852 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 PDE11A-201ENST00000286063 9275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 CRTAM-201ENST00000227348 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 USP30-203ENST00000392784 2483 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 GLI1-201ENST00000228682 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 CCR3-201ENST00000357422 2000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 LINC01346-201ENST00000412674 3242 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRHP20396 ABCA11P-201ENST00000451020 1815 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRHP20396 PCYT1B-203ENST00000379145 5307 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRHP20396 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRHP20396 CPEB1-209ENST00000614918 4882 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRHP20396 SPP1-201ENST00000237623 1581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRHP20396 HMGCR-202ENST00000343975 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRHP20396 OR6N1-203ENST00000641846 2640 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRHP20396 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRHP20396 TRO-208ENST00000420798 3613 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRHP20396 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRHP20396 SIAH1-201ENST00000356721 2415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRHP20396 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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