Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

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Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 NMD3-201ENST00000351193 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 PBX1-212ENST00000540236 6175 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 CLTCL1-202ENST00000427926 5513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 VPS8-227ENST00000625842 4969 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 ABCB1-210ENST00000543898 4524 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 DSTYK-201ENST00000367161 7739 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 EPB41-206ENST00000373798 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 FHDC1-201ENST00000260008 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 TACC2-226ENST00000513429 4114 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 RPL7L1-208ENST00000493763 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 TMF1-201ENST00000398559 6849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 ERICH3-201ENST00000326665 7159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 MYT1L-204ENST00000428368 4850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 LINC01427-202ENST00000635258 4566 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 NUP214-203ENST00000451030 5021 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 RTL10-203ENST00000407472 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC093283.1-201ENST00000565306 1075 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 GPATCH8-208ENST00000591680 4692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 GOLGA8CP-201ENST00000446144 5237 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 PCYT1A-201ENST00000292823 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 FN1-203ENST00000354785 8905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 CACNA1C-216ENST00000399638 6595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 HFE-207ENST00000357618 5286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 LAMA3-203ENST00000399516 9834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 CUL5-201ENST00000393094 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 COL5A2-201ENST00000374866 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 SERPINA10-201ENST00000261994 4978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 CDK5RAP2-203ENST00000360822 5551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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