Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 OSTN-AS1-201ENST00000430375 515 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 LINC02250-201ENST00000422117 2491 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 CFAP61-203ENST00000377293 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 PAX6-282ENST00000640975 2553 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 ZNF585A-202ENST00000356958 6822 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 AL035422.2-201ENST00000603059 565 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 AC110998.1-201ENST00000519029 2053 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPN13Q12923 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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