Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SIX1Q15475 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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