Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYQ6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYQ6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYQ6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYQ6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYQ6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYQ6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYQ6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYQ6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYQ6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYQ6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYQ6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYQ6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYQ6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYQ6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYQ6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYQ6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYQ6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYQ6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYQ6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYQ6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYQ6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
V9GYQ6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
V9GYQ6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.6 ms