Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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ARL2-SNX15V9GYD0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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ARL2-SNX15V9GYD0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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