Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms