Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A2

CYP46A1, Cholesterol 24-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP46A1Q9Y6A2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYP46A1Q9Y6A2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP46A1Q9Y6A2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms