Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SH3BP1Q9Y3L3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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SH3BP1Q9Y3L3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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SH3BP1Q9Y3L3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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SH3BP1Q9Y3L3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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SH3BP1Q9Y3L3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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