Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms