Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPS28Q9Y2Q9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPS28Q9Y2Q9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPS28Q9Y2Q9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPS28Q9Y2Q9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPS28Q9Y2Q9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPS28Q9Y2Q9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPS28Q9Y2Q9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPS28Q9Y2Q9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPS28Q9Y2Q9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPS28Q9Y2Q9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPS28Q9Y2Q9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPS28Q9Y2Q9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms