Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TRAPPC8Q9Y2L5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms