Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRPC6Q9Y210 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPC6Q9Y210 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms