Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms