Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms