Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3C4Q9UKN8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms