Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms