Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms