Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIMS3Q9UJD0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms