Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEMTQ9UBM1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEMTQ9UBM1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms