Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms