Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ABCF3Q9NUQ8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms