Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZCCHC3Q9NUD5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 297 ms