Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC4BQ9NT99 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms