Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TOPORSQ9NS56 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms