Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBP3Q9NS15 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LTBP3Q9NS15 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
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