Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAPOLBQ9NRJ5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms