Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KIAA1549Q9HCM3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KIAA1549Q9HCM3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms