Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms