Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCAF1Q9H7N4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms