Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MED28Q9H204 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms