Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms