Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms