Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM4

GGACT, Gamma-glutamylaminecyclotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGACTQ9BVM4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGACTQ9BVM4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGACTQ9BVM4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGACTQ9BVM4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms