Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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KCNS3Q9BQ31 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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KCNS3Q9BQ31 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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KCNS3Q9BQ31 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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KCNS3Q9BQ31 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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KCNS3Q9BQ31 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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KCNS3Q9BQ31 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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KCNS3Q9BQ31 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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KCNS3Q9BQ31 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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KCNS3Q9BQ31 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
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KCNS3Q9BQ31 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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KCNS3Q9BQ31 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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