Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS1Q99742 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS1Q99742 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms