Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK5RAP2Q96SN8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5RAP2Q96SN8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms