Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms