Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms