Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM44Q96DX7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms