Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HGDQ93099 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HGDQ93099 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HGDQ93099 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HGDQ93099 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HGDQ93099 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HGDQ93099 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HGDQ93099 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HGDQ93099 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
HGDQ93099 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HGDQ93099 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HGDQ93099 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HGDQ93099 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HGDQ93099 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HGDQ93099 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HGDQ93099 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms