Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms